微生物絮凝劑與傳統無機或有機絮凝劑有顯著不同，它們或是直接利用微生物細胞，或是利用微生物細胞壁提取物、代謝產物等。前者是微生物絮凝劑研究的主要方面，至今發現的具有絮凝性能微生物有17種以上，包括霉菌、細菌、放線菌和酵母，后者與有機絮凝劑為同類物質。微生物絮凝劑具有傳統無機或有機絮凝劑所不能比擬的許多優點，如不產生二次污染、生產成本低等。