利用自然界中的微生物對含表面活性劑的廢水進行治理是目前較為有效的處理方法，其具體方法包括：間歇式活性污泥法、生物流化床法、生物接觸氧化法、土壤處理法、厭氧處理法及高效種菌篩選針對降解法等。
間歇式活性污泥法(SaR)
現行的活性污泥法的各種系統和運行方式通常都是連續的，而SBR法系統則是活性污泥法的一種新的運行方式。SBR法的運行操作包括：進水、曝氣、沉淀、排放、待機等五道工序。這五道工序都在曝氣池內進行，因此SBR法系統不需設污泥回流設備、二沉池，曝氣池容積也小于連續式，工藝系統組成簡單，土建和運行費用都較低。孫窮等人曾采用SBR法對洗滌廢水進行了試驗研究。結果表明，對于COD為150mg/L的洗滌廢水，可以達到86%的COD去除率。但若想進一步提高處理效率，保證出水水質，則需適當降低進水的有機負荷。具體聯系污水寶或參見http://www.bnynw.com更多相關技術文檔。
生物流化床法
流化床是以砂、活性炭、焦炭等粒徑較小的顆粒為載體填充在床內，在載體表面形成生物膜，污水以一定流速從下而上流動，使載體處于流化狀態。由于載體的顆粒較小，其總表面積很大(每立方米載體的表面積可達2000～3000m2)，載體上附著的生物量高于任何一種生物處理工藝。同時由于載體處于流化狀態，污水頻繁與生物膜接觸，所以生物膜的活性比較高。強化了傳質過程，且載體在不斷的流動，還能有效地防止堵塞的發生。羅年昆曾采用三相內混生物流化床生化塔對表面活性劑廢水進行了治理研究，結果顯示，當進塔廢水COD在1200mg/L左右時，廢水在塔內的停留時間為2.5～3.5h，其COD去除率可達70%以上。
生物接觸氧化法
生物接觸氧化法是通過在池內填充填料，已經充氧的污水浸沒全部填料并以一定的流速流經填料，填料上長滿生物膜，污水與生物膜充分接觸，在生物膜上微生物的新陳代謝作用下，污水中的有機污染物得以去除，污水得以凈化。同時，由于生物接觸氧化法采用與曝氣池相同的曝氣方法，向微生物提供所需的氧，起攪拌和混合的作用，因而微生物活性較高，處理效果較好。秦永生等人采用生物接觸氧化法處理濰坊合成洗滌劑廠生產廢水獲得成功，在國內首次應用于合成洗滌劑廢水治理工程。他們首先取生活污水處理廠的活性污泥作為掛膜的菌種，待填料表面已有生物膜形成時，再用合成洗滌劑生產廢水與生活污水的混合水樣進行連續進水培養訓化，以后逐漸提高合成洗滌劑生產廢水比例，經培養訓化兩個月后，對于LAS濃度為100mg/L左右的廢水，其COD與LAS的去除率均可達到90%以上。
